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三博远志带您走进RNA深度测序最新分析方法

作者:北京三博远志生物技术有限责任公司 2011-02-25T00:00 (访问量:7991)

近日清华大学研究人员发表了一篇关于RNA深度测序的最新研究论文,这篇文章主要解析了RNA深度测序分析方法。

新一代测序技术又称作深度测序技术,主要特点是测序通量高,测序时间和成本显著下降,把这种高通量测序技术应用到RNA上,也就是将各种类型的转录本用深度测序技术进行高通量定量检测,统称作RNA-seqRNA测序。随着新一代高通量DNA测序技术的快速发展,RNA测序(RNA-seq)已成为基因表达和转录组分析的重要手段。

RNA测序也是分析同一基因的基因亚型的有效方法,这种分析方法需要一些修订模型,尤其是当RNA序列数据不是均匀分布的时候,该文章中提出了一种non-URD(N-URD)模型,可以用于推断亚型表达水平,研究人员通过一系列的系统模拟研究,证明了这种模型超越了原始模型,能恢复主要亚型,分析可变亚型的表达比率。 之后研究人员进一步在RNA测序数据库中应用了这一新模型,结果发现利用这一模型获得的可变亚型表达比率的推论分析更加合理,这些都说明了N-URD模型能提高RNA测序中亚型表达建模和推论的精确性。

近年来随着测序技术的不断发展,测序服务的不断完善,测序服务价格将大幅度的下降,比如今年,人类基因组测序服务的收费可能下降到每个基因组1000美元以下。随着下一代测序机器投放市场,其基因组完全被测序的人数将飙升。(由三博远志编辑)

本文转自三博远志业界新闻:http://www.sunbiotech.com.cn/news_view-id3197.htm

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