DNA甲基化检测--甲基化特异性的PCR实验（methylation-specific PCR, MSP）
甲基化特异性的PCR是一种灵敏度高且操作相对简单的甲基化研究方法。重亚硫酸盐处理DNA后，基因组DNA发生的由甲基化状态决定的序列改变。随后进行引物特异性的PCR。该方法引物设计是关键。MSP中设计两
菌种鉴定
微生物的形状是由基因决定的，基于DNA测序的微生物鉴定法不仅快速，准确，而且不受细菌的培养条件和生长环境影响，对于难以实现人工培养的寄生菌和其它特殊细菌尤其有效。
聚合物分布分析
聚合物包括天然和合成两大类，聚合物的分析包括微观结构分析、各种物理化学性质研究、聚集态结构分析等。MALDI-TOF/TOF已成为测定聚合物分子质量和分析聚合物结构方面一个新的强有力的工具。从质谱中可以直观得到分子质量分布范围和重复单元等信息)可以测定整个分子质量
第三代单分子真菌基因组测序
PacBio三代测序平台的长读长及无需PCR扩增的技术优势，可进一步降低引入人为错误的可能性，克服部分微生物基因组GC含量高或重复序列多等问题，实现对微生物基因组进行更加详细的描绘因。