长链非编码RNA(lncRNA) 因其重要的调控功能而受到研究工作者的广泛关注，许多研究都表明它们与疾病有千丝万缕的关系，或通过调控基因的转录，或通过调节蛋白的功能，但它们在类风湿关节炎（RA）中扮演的角色依然成谜。近日，安徽医科大学叶冬青教授团队在《Biomolecules》发表的文章揭示 H19，GAS5，linc0597这3种lncRNA与类风湿关节炎的发病机制相关联。
在此文章中，研究人员设计了两个阶段的病例-对照研究方案。在第一阶段，研究人员选取77例RA病人样本和78例对照样本来探查H19，GAS5，linc0597在外周血单个核细胞（PBMC）中的表达情况。研究结果表明，与对照样本相比，RA病人样本中的H19，GAS5，linc0597表达显著降低。此外，在RA病人样本中GAS5的表达水平与C-反应蛋白（CRP）负相关。
在第二阶段，结合e-QTL数据库，研究人员甄选了位于这三种lncRNA的重要功能区域，例如3’ UTR、5’UTR、非同义突变和移码突变等区域及其侧翼的14个SNP位点，利用Taqman探针法对828例RA病人样本和780例对照样本进行基因分型分析，阐释了这三种lncRNA的基因多态性与类风湿关节炎易感性的相关性。通过数据分析，研究人员鉴定出2个潜在的功能性SNP与类风湿关节炎易感性有关，它们分别是GAS5 rs6790 和linc0597 rs2680700。
这一研究为进一步探索lncRNA在类风湿关节炎发生发展过程中的确切作用提供了依据。本文第二阶段的研究中使用了Fluidigm公司的EP1高通量基因分型系统及192.24基因分型动态芯片，每张芯片可在一次反应中完成192个样本，每个样本24个SNP位点的基因分型，在获得高质量数据的同时大大缩短了实验周期，并显著降低了实验的成本。
参考文献：
1. Jun Wu 1,2, Tian-Ping Zhang 1,2, Yu-Lan Zhao 1,2,et al, Decreased H19, GAS5, and linc0597 Expression and Association Analysis of Related Gene Polymorphismsin Rheumatoid Arthritis, Biomolecules 2020, 10(1), 55