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美吉生物明星测序服务:环境微生物群落多样性分析

作者:上海美吉生物医药科技有限公司 2011-11-28T00:00 (访问量:7184)

 

 美吉生物邀您抢先体验美吉生物明星测序服务:环境微生物群落多样性分析
 

美吉生物明星测序服务——环境微生物群落多样性分析,基于第二代高通量测序技术(Roche 454),给力呈现环境样品中的微生物种类及其相对丰度。一套完整的生物信息分析流程,完美揭示大量数据背后隐藏的“秘密”。500余例的成功案例,使美吉生物积累了丰富的经验,能针对不同的课题需求,提供最为专业、合理、高性价比的实验方案。选择美吉,选择满意!
 
美吉优势
采用定向测序技术,避免了非定向测序造成的数据冗余,能充分利用每条有效序列,且便于后期的菌群分类处理。
开发了一套稳定的多样本平行测序实验方案,并解决了样本间数据量不平衡的技术难题,一次可实现200个样品的平行测序。
众多的成功案例,使美吉生物在环境微生物群落多样性测序及分析方面处于国内**地位。
 
技术路线
 
生物信息分析
1. 数据统计分析
1) 有效测序数据统计
2) 可供精准分析的数据统计
2. 数据回归样品
1) 根据tag信息将测序数据回归各自样品
3. 单样品微生物种类及丰度分析
1) 序列聚类OTUOperational Taxonomic Units
2) 取样深度判定(Rarefaction Curve
3) 计算菌群多样性和丰度指数
4) 单样品群落结构分析
4. 多样品间比较分析
1) 全样品相似度比对
2) 多样品OTU比较
3) 多样品群落结构分析
4) PCAPrincipal component analysis)分析
5) Weighted unifrac PCA分析
6) 组间显著性差异分析
 
成功案例
美吉生物已成功完成环境微生物群落多样性分析500余例,涉及土壤、水样(海洋、湖泊、鱼塘)、污泥、发酵罐、生物膜、叶子表面、肠道、瘤胃、口腔等多种环境样品。
 
 
其他链接
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