单细胞转录组学测序(Single cell RNA-seq):是对单个细胞的转录组进行研究的一项技术,其原理是将分离的单个细胞中微量的mRNA通过扩增后再进行高通量测序,主要用于研究异质性细胞的独特表型和生物学功能,有助于发现新的稀有细胞类型,深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。
为什么做单细胞转录组学测序?
1.在整个石榴中找到坏石榴籽=在一块癌组织中找到导致癌症扩散的癌细胞和对抗癌症的免疫细胞。
2.Science十大科学突破之首,疾病检测及治疗手段生命科学研究热门工具。
工作流程BIOTREE提供单细胞3'或5'转录组逆转录产物进行文库构建、以及BCR、TCR和VDJ文库构建、测序和分析,供老师根据关注的研究方向进行选择。
核心技术原理
3min快速生成15万个油包水液滴;
细胞捕获率高达65%;
1000细胞双胞率低至0.3%;
Cell Barcode:标记不同的细胞;约150万种;
UMI:标记同一细胞来源的不同mRNA。
部分数据结果展示获得原始测序数据(Sequenced Reads)后,⽣信分析主要包括:数据质控、构建表达矩阵、细胞聚类、差异基因分析以及富集分析等。
可接收的样本类型
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